Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAT1AQ00266 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms