Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP2C1P98194 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2C1P98194 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms