Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms