Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CABP4P57796 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CABP4P57796 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CABP4P57796 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CABP4P57796 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CABP4P57796 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CABP4P57796 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABP4P57796 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CABP4P57796 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABP4P57796 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABP4P57796 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABP4P57796 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABP4P57796 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABP4P57796 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABP4P57796 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CABP4P57796 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CABP4P57796 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABP4P57796 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABP4P57796 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABP4P57796 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CABP4P57796 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABP4P57796 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABP4P57796 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABP4P57796 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABP4P57796 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABP4P57796 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABP4P57796 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABP4P57796 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABP4P57796 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABP4P57796 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CABP4P57796 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CABP4P57796 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CABP4P57796 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CABP4P57796 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CABP4P57796 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CABP4P57796 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CABP4P57796 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CABP4P57796 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CABP4P57796 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CABP4P57796 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms