Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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PGGT1BP53609 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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PGGT1BP53609 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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PGGT1BP53609 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PGGT1BP53609 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PGGT1BP53609 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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