Protein–RNA interactions for Protein: P31930

UQCRC1, Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRC1P31930 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UQCRC1P31930 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UQCRC1P31930 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms