Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms