Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms