Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YY1P25490 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
YY1P25490 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.31■■□□□ 1
YY1P25490 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
YY1P25490 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.31■■□□□ 1
YY1P25490 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YY1P25490 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YY1P25490 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YY1P25490 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
YY1P25490 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YY1P25490 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
YY1P25490 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
YY1P25490 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
YY1P25490 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
YY1P25490 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
YY1P25490 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YY1P25490 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YY1P25490 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
YY1P25490 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YY1P25490 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
YY1P25490 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
YY1P25490 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
YY1P25490 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC21.29■■□□□ 1
YY1P25490 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
YY1P25490 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
YY1P25490 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.29■■□□□ 1
YY1P25490 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
YY1P25490 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
YY1P25490 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
YY1P25490 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
YY1P25490 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YY1P25490 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YY1P25490 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
YY1P25490 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
YY1P25490 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YY1P25490 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
YY1P25490 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YY1P25490 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YY1P25490 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
YY1P25490 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YY1P25490 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
YY1P25490 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YY1P25490 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YY1P25490 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
YY1P25490 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YY1P25490 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
YY1P25490 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YY1P25490 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
YY1P25490 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.28■■□□□ 1
YY1P25490 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC21.28■■□□□ 1
YY1P25490 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
YY1P25490 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
YY1P25490 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
YY1P25490 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
YY1P25490 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
YY1P25490 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YY1P25490 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
YY1P25490 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.28■■□□□ 1
YY1P25490 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YY1P25490 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YY1P25490 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YY1P25490 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
YY1P25490 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
YY1P25490 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YY1P25490 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
YY1P25490 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YY1P25490 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YY1P25490 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
YY1P25490 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
YY1P25490 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YY1P25490 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC21.27■■□□□ 1
YY1P25490 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
YY1P25490 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.27■■□□□ 1
YY1P25490 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms