Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1P21675 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1P21675 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1P21675 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1P21675 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1P21675 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1P21675 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1P21675 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1P21675 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1P21675 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1P21675 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1P21675 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1P21675 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1P21675 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1P21675 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1P21675 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1P21675 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1P21675 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1P21675 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1P21675 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1P21675 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1P21675 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1P21675 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1P21675 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1P21675 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1P21675 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1P21675 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1P21675 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1P21675 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1P21675 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1P21675 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1P21675 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1P21675 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1P21675 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1P21675 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1P21675 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1P21675 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1P21675 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1P21675 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1P21675 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1P21675 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms