Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI3P10071 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI3P10071 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI3P10071 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI3P10071 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI3P10071 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI3P10071 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI3P10071 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI3P10071 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI3P10071 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI3P10071 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI3P10071 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI3P10071 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI3P10071 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI3P10071 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI3P10071 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI3P10071 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI3P10071 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI3P10071 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI3P10071 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI3P10071 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI3P10071 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI3P10071 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI3P10071 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI3P10071 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI3P10071 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI3P10071 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI3P10071 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI3P10071 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI3P10071 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI3P10071 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI3P10071 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI3P10071 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI3P10071 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI3P10071 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI3P10071 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI3P10071 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI3P10071 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI3P10071 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI3P10071 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI3P10071 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI3P10071 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI3P10071 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI3P10071 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI3P10071 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI3P10071 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI3P10071 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI3P10071 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI3P10071 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI3P10071 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI3P10071 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI3P10071 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI3P10071 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI3P10071 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI3P10071 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI3P10071 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI3P10071 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI3P10071 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI3P10071 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI3P10071 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI3P10071 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI3P10071 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI3P10071 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI3P10071 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI3P10071 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI3P10071 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI3P10071 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI3P10071 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI3P10071 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI3P10071 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI3P10071 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI3P10071 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI3P10071 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLI3P10071 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI3P10071 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI3P10071 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI3P10071 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI3P10071 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI3P10071 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI3P10071 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI3P10071 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI3P10071 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI3P10071 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI3P10071 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GLI3P10071 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI3P10071 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI3P10071 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI3P10071 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI3P10071 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI3P10071 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI3P10071 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI3P10071 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI3P10071 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI3P10071 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI3P10071 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI3P10071 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI3P10071 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI3P10071 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI3P10071 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GLI3P10071 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms