Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms