Protein–RNA interactions for Protein: P08949

NMB, Neuromedin-B, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBP08949 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NMBP08949 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NMBP08949 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NMBP08949 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NMBP08949 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NMBP08949 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NMBP08949 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NMBP08949 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NMBP08949 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NMBP08949 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NMBP08949 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NMBP08949 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NMBP08949 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NMBP08949 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NMBP08949 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NMBP08949 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NMBP08949 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NMBP08949 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NMBP08949 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NMBP08949 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NMBP08949 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NMBP08949 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NMBP08949 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NMBP08949 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NMBP08949 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NMBP08949 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NMBP08949 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NMBP08949 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NMBP08949 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NMBP08949 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NMBP08949 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NMBP08949 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NMBP08949 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NMBP08949 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NMBP08949 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NMBP08949 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NMBP08949 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NMBP08949 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NMBP08949 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NMBP08949 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NMBP08949 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NMBP08949 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NMBP08949 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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NMBP08949 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NMBP08949 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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NMBP08949 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NMBP08949 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NMBP08949 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NMBP08949 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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NMBP08949 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NMBP08949 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NMBP08949 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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NMBP08949 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMBP08949 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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NMBP08949 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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NMBP08949 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMBP08949 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMBP08949 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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NMBP08949 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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NMBP08949 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMBP08949 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMBP08949 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMBP08949 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMBP08949 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMBP08949 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NMBP08949 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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