Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPBP07199 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPBP07199 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPBP07199 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPBP07199 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPBP07199 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPBP07199 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPBP07199 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPBP07199 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPBP07199 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPBP07199 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPBP07199 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPBP07199 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPBP07199 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPBP07199 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPBP07199 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPBP07199 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPBP07199 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPBP07199 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPBP07199 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPBP07199 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPBP07199 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPBP07199 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPBP07199 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPBP07199 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPBP07199 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPBP07199 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPBP07199 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPBP07199 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPBP07199 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPBP07199 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPBP07199 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPBP07199 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPBP07199 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPBP07199 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPBP07199 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPBP07199 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPBP07199 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPBP07199 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPBP07199 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPBP07199 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPBP07199 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPBP07199 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPBP07199 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPBP07199 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPBP07199 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPBP07199 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPBP07199 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPBP07199 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPBP07199 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPBP07199 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPBP07199 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPBP07199 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPBP07199 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPBP07199 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPBP07199 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPBP07199 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPBP07199 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPBP07199 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPBP07199 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPBP07199 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPBP07199 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPBP07199 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPBP07199 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPBP07199 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms