Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFLP07196 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFLP07196 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFLP07196 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFLP07196 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFLP07196 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFLP07196 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFLP07196 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFLP07196 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFLP07196 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFLP07196 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFLP07196 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFLP07196 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFLP07196 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFLP07196 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFLP07196 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFLP07196 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFLP07196 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFLP07196 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFLP07196 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFLP07196 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFLP07196 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFLP07196 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFLP07196 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFLP07196 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFLP07196 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEFLP07196 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEFLP07196 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEFLP07196 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms