Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTMAP06454 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTMAP06454 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTMAP06454 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTMAP06454 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTMAP06454 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTMAP06454 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTMAP06454 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTMAP06454 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTMAP06454 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTMAP06454 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTMAP06454 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTMAP06454 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTMAP06454 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTMAP06454 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms