Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 ANAPC2-203ENST00000483432 793 ntTSL 219.55■□□□□ 0.725e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 STXBP3-202ENST00000469338 294 ntTSL 219.49■□□□□ 0.715e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ARHGAP22-209ENST00000471013 690 ntTSL 319.47■□□□□ 0.715e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 CDK11B-206ENST00000615951 2227 ntTSL 1 (best)19.35■□□□□ 0.693e-16■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 MIF-202ENST00000465752 589 ntTSL 1 (best)19.35■□□□□ 0.695e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 GPRC5B-211ENST00000570142 568 ntTSL 419.34■□□□□ 0.695e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PKD1-214ENST00000483024 465 ntTSL 519.33■□□□□ 0.695e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ALPK1-218ENST00000515330 1008 ntTSL 219.33■□□□□ 0.695e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.681e-7■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.642e-8■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PNPLA6-217ENST00000599311 1005 ntTSL 519.06■□□□□ 0.645e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.632e-7■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ADAM8-209ENST00000559180 560 ntTSL 318.91■□□□□ 0.627e-9■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PKD1-204ENST00000468674 490 ntTSL 518.82■□□□□ 0.65e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RHOC-217ENST00000527563 579 ntTSL 318.8■□□□□ 0.65e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PKD1-235ENST00000568591 2545 ntTSL 218.78■□□□□ 0.65e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 EML4-205ENST00000409040 962 ntTSL 1 (best)18.76■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PKD1-215ENST00000483558 577 ntTSL 518.74■□□□□ 0.595e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 AP2A2-221ENST00000531548 554 ntTSL 418.67■□□□□ 0.585e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 AP2A2-210ENST00000527024 527 ntTSL 418.67■□□□□ 0.585e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.575e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.575e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.573e-8■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.565e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 AP2A2-223ENST00000534485 556 ntTSL 418.47■□□□□ 0.555e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 NUP54-205ENST00000507257 1938 ntTSL 518.41■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.525e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.525e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ADAM8-210ENST00000560135 818 ntTSL 1 (best)18.27■□□□□ 0.527e-9■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RCCD1-204ENST00000555737 3157 ntTSL 1 (best)18.19■□□□□ 0.55e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.493e-16■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PIH1D1-222ENST00000601825 381 ntTSL 318.09■□□□□ 0.495e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.485e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PIH1D1-213ENST00000597415 874 ntTSL 517.95■□□□□ 0.465e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PIH1D1-218ENST00000599791 966 ntTSL 217.95■□□□□ 0.465e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.465e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.445e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 CDK11B-205ENST00000611150 2350 ntTSL 1 (best)17.71■□□□□ 0.433e-16■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RPL23A-208ENST00000580755 412 ntTSL 217.69■□□□□ 0.425e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 SEMA3F-203ENST00000414301 936 ntTSL 517.66■□□□□ 0.425e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.43e-16■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.43e-16■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.45e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PMF1-206ENST00000606952 1275 ntTSL 1 (best)17.55■□□□□ 0.45e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.45e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 NAB1-207ENST00000426601 545 ntTSL 417.5■□□□□ 0.395e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ST6GALNAC6-210ENST00000481355 466 ntTSL 317.5■□□□□ 0.395e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PIH1D1-206ENST00000595516 841 ntTSL 317.5■□□□□ 0.395e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.395e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PNPLA6-211ENST00000595264 800 ntTSL 317.35■□□□□ 0.375e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.375e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.375e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ADAM8-206ENST00000486609 776 ntTSL 517.33■□□□□ 0.367e-9■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PIH1D1-217ENST00000599366 833 ntTSL 317.24■□□□□ 0.355e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.345e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 INCENP-206ENST00000533896 570 ntTSL 417.16■□□□□ 0.345e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 DLK1-203ENST00000392848 555 ntTSL 417.1■□□□□ 0.332e-8■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PMF1-205ENST00000497069 837 ntTSL 317.1■□□□□ 0.335e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.325e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.315e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.315e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 APOE-205ENST00000485628 771 ntTSL 1 (best)16.95■□□□□ 0.35e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.285e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.283e-16■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RPLP2-208ENST00000532004 353 ntTSL 316.79■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.275e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.263e-16■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.255e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 TMEM129-203ENST00000460722 1100 ntTSL 1 (best)16.59■□□□□ 0.255e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.245e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PGGHG-206ENST00000476372 2879 ntTSL 216.54■□□□□ 0.245e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 CEP120-208ENST00000513565 3973 ntTSL 1 (best)16.53■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 EVL-219ENST00000556258 567 ntTSL 216.51■□□□□ 0.235e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 FNTB-206ENST00000555742 725 ntTSL 516.43■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 TRIM41-207ENST00000515223 5707 ntTSL 216.36■□□□□ 0.211e-12■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.25e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.195e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.185e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 FANCA-220ENST00000566409 395 ntTSL 1 (best)16.06■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 DIS3-204ENST00000490646 2934 ntTSL 516.06■□□□□ 0.165e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 TELO2-204ENST00000564507 903 ntTSL 316.04■□□□□ 0.165e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PHF20L1-208ENST00000395383 3229 ntTSL 515.94■□□□□ 0.145e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ALPK1-208ENST00000505127 2295 ntTSL 215.94■□□□□ 0.145e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ARV1-204ENST00000450711 991 ntTSL 315.83■□□□□ 0.124e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 EVL-217ENST00000555848 1547 ntTSL 1 (best)15.78■□□□□ 0.125e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 INCENP-203ENST00000528037 1372 ntTSL 1 (best)15.78■□□□□ 0.125e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 RNF103-205ENST00000472680 440 ntTSL 315.74■□□□□ 0.115e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 KMT2D-206ENST00000550356 445 ntTSL 315.73■□□□□ 0.115e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.115e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 PIH1D1-205ENST00000595074 1037 ntTSL 215.62■□□□□ 0.095e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.082e-8■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 UCP2-207ENST00000543714 567 ntTSL 215.51■□□□□ 0.075e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.075e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ANKLE2-207ENST00000539605 10890 ntTSL 1 (best)15.48■□□□□ 0.075e-10■■■■■ 120.6
SF3B1O75533 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 120.6
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1486.3 ms