Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMD3O43242 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms