Protein–RNA interactions for Protein: H7C1C5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1C5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1C5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H7C1C5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H7C1C5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms