Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC160A6NGH7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms