Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VWA8A3KMH1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms