Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PLXND1Q9Y4D7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms