Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNSTRNQ9Y448 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms