Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL20Q9Y2M5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL20Q9Y2M5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL20Q9Y2M5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL20Q9Y2M5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL20Q9Y2M5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL20Q9Y2M5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms