Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FZD4Q9ULV1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FZD4Q9ULV1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms