Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRPF3Q9ULD4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms