Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDRG3Q9UGV2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms