Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms