Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS4

DNAJB11, DnaJ homolog subfamily B member 11, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB11Q9UBS4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB11Q9UBS4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms