Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC17A6Q9P2U8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC17A6Q9P2U8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms