Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TOR4AQ9NXH8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TOR4AQ9NXH8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms