Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SALL1Q9NSC2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms