Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TM7SF3Q9NS93 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM7SF3Q9NS93 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms