Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM38AQ9H6F2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms