Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLSTN2Q9H4D0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLSTN2Q9H4D0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms