Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMIM3Q9BZL3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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