Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI3

APH1A, Gamma-secretase subunit APH-1A, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1AQ96BI3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APH1AQ96BI3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APH1AQ96BI3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APH1AQ96BI3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APH1AQ96BI3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APH1AQ96BI3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APH1AQ96BI3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APH1AQ96BI3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APH1AQ96BI3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APH1AQ96BI3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APH1AQ96BI3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APH1AQ96BI3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APH1AQ96BI3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APH1AQ96BI3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APH1AQ96BI3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APH1AQ96BI3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APH1AQ96BI3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APH1AQ96BI3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms