Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMPDL3BQ92485 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms