Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCG3Q8WXD2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms