Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSKUQ8WUA8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSKUQ8WUA8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms