Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTP9

XAGE3, X antigen family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAGE3Q8WTP9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XAGE3Q8WTP9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms