Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZW8

TNS4, Tensin-4, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS4Q8IZW8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNS4Q8IZW8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms