Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms