Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF554Q86TJ5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms