Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYDE1Q6ZW31 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYDE1Q6ZW31 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms