Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms