Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms