Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q6Q795 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q6Q795 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q6Q795 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q6Q795 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q6Q795 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q6Q795 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q6Q795 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q6Q795 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q6Q795 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q6Q795 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q6Q795 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Q6Q795 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms