Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q6P435 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q6P435 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6P435 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6P435 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6P435 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6P435 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6P435 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6P435 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6P435 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6P435 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6P435 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6P435 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6P435 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6P435 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6P435 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6P435 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6P435 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6P435 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6P435 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6P435 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6P435 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6P435 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6P435 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6P435 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q6P435 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q6P435 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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