Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q1T7F1 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q1T7F1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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